• Le laboratoire de Lyon concourt principalement à l'amélioration de la santé des ruminants.

• Il est spécialisé dans les maladies neurodégénératives telles que les encéphalopathies spongiformes transmissibles (EST), l’antibiorésistance, les mycoplasmoses, les affections virales émergentes (fièvre de la vallée du Rift, hantavirus), l’épidémiologie des maladies animales;
   
• il étudie les agents responsables des maladies majeures et émergentes;
   
• il étudie les bactéries pathogènes des ruminants (résistance aux antibiotiques et virulence);
   
• il surveille l'apparition et la diffusion des maladies et analyse leurs causes.
  
  
  
   

• Il est  laboratoire national de référence (LNR) pour:

• les EST animales (encéphalopathie spongiforme bovine, et tremblante);
   
• la fièvre de la vallée du Rift (sérologie);
   
• l’antibiorésistance, avec les laboratoires de l’Anses de Fougères, de Maisons-Alfort et de Ploufragan-Plouzané. 

Dans ce cadre, il fournit un appui scientifique et technique pour le contrôle vétérinaire exercé par les autorités (validation de données et de méthodes d'analyse, formation des laboratoires de terrain, gestion des données d'épidémiosurveillance…).


 

Il est également laboratoire de référence de l’Organisation mondiale de la santé animale (OIE) pour la péripneumonie contagieuse bovine (PPCB) et laboratoire de référence associé OIE pour la fièvre de la vallée du Rift, avec l’Institut Pasteur à Paris.
 

• Le laboratoire de Lyon comprend par ailleurs une unité dédiée à la surveillance et à l'étude des phénomènes de résistance des bio-agresseurs des végétaux aux produits phytosanitaires. Il est spécialisé dans la surveillance des phénomènes de résistance des bio-agresseurs des végétaux aux produits phytosanitaires.
  • Consultez la présentation de l'unité Résistance aux produits phytosanitaire
  • Consultez les notes techniques sur la gestion des resistances (vigne, céréales)

L’unité Résistances aux produits phytosanitaires est membre du Réseau de réflexion et de recherches sur les résistances aux Pesticides (R4P), aux côtés de l’Inra et du ministère de l’Agriculture. Le réseau R4P a pour objectif d’accroître les échanges entre les scientifiques et la diffusion des méthodes de détection des résistances entre les communautés de chercheurs, notamment pour mieux prédire, retarder et/ou gérer la sélection des résistances.

• Consulter le site du réseau https://www.r4p-inra.fr
• Twitter : @R4P_network
• Adresse mail : contact-r4p@inra.fr

Chaque unité du laboratoire de Lyon développe des projets de recherche essentiellement en rapport avec ses travaux de référence et de surveillance. A titre d’exemple, le laboratoire explore les sujets suivants : 

• Développement et application de modèles de rongeurs transgéniques et conventionnels pour l'étude des encéphalopathies spongiformes transmissibles (EST),
• Caractérisation biochimique et par bio-essais des formes atypiques d'encéphalopathies spongiformes bovines (ESB) et de tremblante,
• Caractérisation des anomalies de repliement protéique induites par des pesticides dans les maladies neuro-dégénératives humaines,
• Épidémiologie descriptive et analytique de l'ESB et des tremblantes classique et atypique: études d'observation et modélisation,
• Épidémiologie descriptive de l'antibiorésistance chez les bactéries issues de ruminants,
• Mécanismes de résistance aux antibiotiques chez les bactéries issues de ruminants,
• Facteurs de virulence chez les bactéries animales et lien avec l'antibiorésistance,
• Marqueurs moléculaires et outils génétiques pour l'épidémiologie et le diagnostic des mycoplasmoses des ruminants,
• Facteurs de pathogénicité et marqueurs associés à la virulence des mycoplasmes pathogènes des ruminants,
• Épidémiologie des infections à Mycoplasma bovis,
• Surveillance syndromique (mortalité des animaux de rente, phénomènes pathologiques dans la faune sauvage).
   

Dans le domaine de la référence (développement de méthodes d’analyse, organisation d’essais interlaboratoires, expertise…), le laboratoire de Lyon couvre les mandats suivants :

• Laboratoire national de référence pour les EST animales (encéphalopathie spongiforme bovine (ESB) et tremblante),
   
• Laboratoire de référence OIE pour la péripneumonie contagieuse bovine (PPCB),
   
• Laboratoire de référence sans mandat pour l'agalaxie contagieuse des petits ruminants,
   
• Laboratoire national de référence pour l'antibiorésistance (avec les laboratoires de Maisons-Alfort, de Fougères et de Ploufragan-Plouzané),
   
• Laboratoire national de référence pour la fièvre de la vallée du Rift (sérologie),
   
• Laboratoire de référence associé OIE pour la fièvre de la vallée du Rift (avec l'Institut Pasteur).

Types d'analyses effectuées

• EST: mise en œuvre des techniques de référence pour les confirmations des diagnostics de première intention réalisés de manière décentralisée pour les différents canaux de surveillance de l'ESB et de la tremblante (réseau clinique, tests en équarrissage et en abattoir) et pour le typage moléculaire des prions impliqués dans ces maladies (discrimination entre ESB classique et atypique, tremblantes classique et atypique).
   
• Mycoplasmoses : recherches sérologiques PPCB, réalisées dans le cadre d'exportations ou d'achats, sérologie agalaxie contagieuse.
   
• Bactériologie : confirmation des phénotypes de résistance de première intention réalisés par les laboratoires membres du réseau d'épidémiosurveillance de l'antibiorésistance animale.
   
• Résapath : détermination d’antibiorésistances, analyse des tendances épidémiologiques spacio-temporelles des résistances aux antibiotiques des bactéries d’origine animales.

Essais inter-laboratoires d'aptitude (EILA)

• Encéphalopathies spongiformes transmissibles.
   
• Antibiorésistance.
   
• Mycoplasmes.

Épidémiosurveillance

• Réseaux et programmes de surveillance de l'ESB et de la tremblante.
   
• Résapath (réseau de surveillance de l'antibiorésistance des bactéries pathogènes d'origine animale).
   
• Vigimyc (réseau de surveillance des mycoplasmes pathogènes des ruminants).
   
• Programmes de surveillance de la résistance des bio-agresseurs des végétaux aux produits phytosanitaires.
   

Au plan régional

Centre national de la recherche scientifique, École nationale supérieure Lyon sciences, Fédération des éleveurs et vétérinaires en convention, Hôpital Neurologique de Lyon, Institut de biologie et chimie des protéines, Institut national de la santé et de la recherche médicale, Centre national de référence des Staphylocoques (Lyon), Université Claude Bernard-Lyon I

Au plan national

Agence française de sécurité sanitaire des produits de santé,Commissariat à l'énergie atomique, Centre de coopération internationale en recherche agronomique pour le développement, Centre national de la recherche scientifique, Écoles vétérinaires d'Alfort, de Nantes et de Toulouse, VetAgroSup, Institut national de la recherche agronomique, Institut national de la santé et de la recherche médicale, Institut de l'élevage, Institut Pasteur, Observatoire national de l'épidémiologie de la résistance bactérienne aux antibiotiques, Société nationale des groupements techniques vétérinaires 

Au plan international

Institute for Disease control (CIDC, Pays-Bas), Centre de recherche en santé animale (CISA, Espagne), Département de microbiologie fondamentale (Université de Lausanne, Suisse), Institute for Animal Breeding (FAL, Allemagne), Friedrich Loeffler Institute (FLI, Allemagne), Central Public Health Institute (ISS, Italie), Institut zooprophylactique expérimental (IZSP, Italie), National Microbiology Laboratory Public Health Agency of Canada (NML, Canada), National Veterinary Institute (NVI, Norvège), National Veterinary Institute (SVA, Suède), United States Department of Agriculture (USDA), Veterinary Laboratories Agency (VLA, Royaume-Uni), Centro de Investigacion en Sanidad Animal (INIA, Spain).