Laboratoire de Lyon

Polyvalent et positionné sur cinq axes stratégiques transversaux de l'Anses, le laboratoire de Lyon intervient dans les domaines suivants :

• l’antibiorésistance ;
• l’épidémiologie et la surveillance en santé animale, en sécurité sanitaire des aliments, en santé végétale, et pour l’antibiorésistance ;
• l’exposition et la toxicologie des contaminants chimiques, et en particulier leur lien avec l’agrégation protéique observée dans les maladies neuro-dégénératives et du neuro-développement animales et humaines ;
• la santé animale, via la problématique des mycoplasmoses animales ;
• la santé végétale, via l’étude de résistances aux produits de protection des plantes.

Le laboratoire détient plusieurs mandats de référence : il est laboratoire national de référence (LNR) pour les encéphalopathies spongiformes transmissibles animales (encéphalopathie spongiforme bovine (ESB) et tremblante) et coordonne le mandat de l’Anses comme centre de référence de la FAO (Organisation des Nations Unies pour l’alimentation et l’agriculture) pour l’antibiorésistance.

Il est également impliqué dans les plateformes nationales d’épidémiosurveillance en santé animale, en santé végétale et en sécurité de la chaîne alimentaire.

Le laboratoire co-anime deux grands réseaux de surveillance :

• le Résapath, réseau d’épidémiosurveillance de l’antibiorésistance des bactéries pathogènes d’origine animale ;
• le réseau Vigimyc pour l’épidémiosurveillance des mycoplasmoses des ruminants.

Enfin, il coordonne la rédaction et l’édition du Bulletin Epidémiologique Santé animale - Alimentation. Réalisée par l’Anses et la Direction générale de l'alimentation (DGAL), cette revue scientifique française en libre accès est un outil d'échange d'informations entre l'Anses, la DGAL et l'ensemble des acteurs locaux, régionaux et nationaux œuvrant dans le champ de la santé animale et de la sécurité sanitaire des aliments.

Le laboratoire réalise l’ensemble de ses prestations sur la base d’un système de management de la qualité et sur des méthodes documentées. À ce titre, il est accrédité selon le référentiel NF EN ISO/CEI 17025, sa portée d’accréditation est disponible sur le site du COFRAC (1-2287).

• Unité antibiorésistance et virulence bactériennes (AVB)
• Unité Épidémiologie et Appui à la Surveillance (EAS)
• Unité Maladies neurodégénératives et du neuro-développement (MN2D)
• Unité mixte de recherche Mycoplasmoses animales (UMR MYCO)
• Unité sous contrat Caractérisation et suivi des phénomènes d’évolution des résistances (USC CASPER)

Le laboratoire s’attache à maintenir ses nombreuses collaborations avec d’autres organismes de recherche au niveau national et international, en particulier dans le cadre d’appels à projet (Ecoantibio, EU JAMRAI 2, OH AMR, Partnership AHW, Agralife…), la contribution à de gros consortiums nationaux et internationaux demeurant la principale source de financement et de visibilité du laboratoire sur le plan de la recherche.

Au-delà de ces collaborations sur projets, le laboratoire a développé des partenariats plus formels.

Les liens avec VetAgro Sup sont forts, notamment via l’UMR MYCO en cotutelle Anses - VetAgro Sup. Le laboratoire est également en relation étroite avec les équipes INRAe et notamment dans le domaine de la santé végétale avec l’USC CASPER qui étudie les phénomènes de résistance au produits phytosanitaires.

Le laboratoire de Lyon contribue au réseau thématique de recherche pour la santé et le bien-être animal en région Auvergne Rhône-Alpes (SAARA) qu’il a créé en 2018 avec INRAe et VetAgro Sup. L’objectif est d’initier et de faire vivre un réseau des forces régionales impliquées dans la recherche en santé et bien-être des animaux.

Sur la thématique de l’antibiorésistance, le laboratoire interagit régulièrement avec les CNR à l’échelle nationale. Il a par ailleurs une convention de partenariat avec la fondation Mérieux et promeut des collaborations à l’international en termes de formations ou d’essais interlaboratoires. Un lien privilégié a été établi avec l’Université de Sousse en Tunisie permettant notamment l’encadrement en cotutelle de plusieurs thésards sur le sujet de l’antibiorésistance.

Positionné au cœur du Biodistrict de Lyon Gerland, le laboratoire Anses de Lyon est également membre de LyonBiopole. Le laboratoire est également membre associé de l’Université de Lyon depuis 2015. Il s’intègre dans le projet porté par cette université. Ce positionnement est un atout pour son ancrage régional, notamment via le renforcement de la recherche associée à l’accueil et à l’encadrement de masters ou de doctorants en collaboration avec les écoles doctorales, sur les disciplines en biologie mais aussi les disciplines issues des sciences économiques et sociales.

Dans cet écosystème régional, l’Anses Lyon contribue à plusieurs grands projets structurants :

• le projet Shape-MED@Lyon, un projet ambitieux et transformant pour la recherche de demain en région lyonnaise sélectionné dans le cadre de l’appel à projet PIA4 ExcellenCES,
• le projet EUR EID@Lyon sélectionné dans le cadre du plan « Compétences et métiers d’avenir » 2021-2025 de France 2030, et intégrant l’Institut One Health (IOH),
• la création en région Auvergne-Rhône-Alpes d’un Biocluster européen en immuno-infectiologie dans le cadre du plan d’investissement France 2030.